Projektübersicht Joint Funding

NonCoMs in Cancer Genomes (Identifying and Understanding Non-coding Mutations in Cancer Genome)

Programm: EOM Förderlinie: INNOVATION Projektart: Forschungsprojekt Entität: Hirntumor, Hautkrebs Status: abgeschlossen

Bei genetischen Tumoranalysen konzentrierte man sich bislang auf Mutationen, die zu veränderten Proteinen führen. Sie gelten häufig als Auslöser für bösartige Tumoren. Das Projekt „Identifying and understanding non-coding mutations in cancer genomes“ ging einen wichtigen Schritt weiter und spürte sogenannten nicht-kodierenden Mutationen in Krebszellen nach, die nicht zu veränderten Proteinen führen, sondern in Regionen liegen, die die Aktivität wichtiger Krebsgene verändern. Untersuchungen wurden speziell an Tumoren der Haut (Melanome) und des Gehirns (Glioblastome) durchgeführt. Hinsichtlich der Melanome konzentrierte sich ein besonderer Schwerpunkt auf die Bedeutung von nicht-kodierenden Mutationen in den Regulationsbereichen der Gene TERT und DPH3/OXNAD1. Für beide Gene konnte festgestellt werden, dass die nicht-kodierenden Mutationen die Tumorentwicklung fördern und somit als „oncogene“ Mutationen bezeichnet werden können. Auch für Gliome konnte die onkogene Bedeutung der nicht-kodierenden TERT Mutationen eindeutig nachgewiesen werden. Darüber hinaus analysierten wir tiefe Gesamtgenomsequenzierungsdaten eines Satzes von Oligodendrogliom-Probenpaaren, die aus primären und gematchten rezidivierten Proben gewonnen wurden, mit evolutionären Modellen des Tumorwachstums. Diese Studie ergab eine Zusammensetzung von Tumorzell-Subpopulationen, die in den meisten Fällen auf eine laufende Selektion maligner Subklone während des Tumorwachstums schließen lässt. Wir identifizierten häufig deutlich vorherrschende Subklone unter positiver Selektion bei primären und rezidivierenden Tumoren. Laufende Arbeiten zielen darauf ab, den Selektionsvorteil abzuschätzen, der durch die assoziierten Treibermutationen entsteht. 

Partnerstandorte

Dresden, Essen/Düsseldorf, Heidelberg, Tübingen

Koordinierende